IPP Software Navigation Tools IPP Links Communication Pan-STARRS Links

Ignore:
Timestamp:
Feb 17, 2006, 7:13:42 AM (20 years ago)
Author:
magnier
Message:

bulk merge of eam_rel9_p0 onto this branch

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • branches/rel10_ifa/psModules/src/detrend/pmMaskBadPixels.c

    r5543 r6448  
     1//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
     2// XXX WARNING: I have completely replaced this file with an OLD VERSION (that works) instead of the
     3// one that was being worked on.
     4//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
     5
    16/** @file  pmMaskBadPixels.c
    27 *
    … …  
    1924 *  @author Ross Harman, MHPCC
    2025 *
    21  *  @version $Revision: 1.3 $ $Name: not supported by cvs2svn $
    22  *  @date $Date: 2005-11-18 19:43:14 $
     26 *  @version $Revision: 1.3.12.1 $ $Name: not supported by cvs2svn $
     27 *  @date $Date: 2006-02-17 17:13:41 $
    2328 *
    2429 *  Copyright 2004 Maui High Performance Computing Center, University of Hawaii
    … …  
    3136#include<stdio.h>
    3237#include<math.h>
    33 #include<string.h>
     38#include<strings.h>
    3439
    3540#include "pmMaskBadPixels.h"
    3641#include "pmMaskBadPixelsErrors.h"
    37 #include "pmSubtractBias.h"
    3842
    39 //XXX: REmove, autoconf is broken.
    40 #define PS_WARN_PTR_NON_NULL(NAME) \
    41 if ((NAME) == NULL) { \
    42     psLogMsg(__func__, PS_LOG_WARN, "WARNING: %s is NULL.", #NAME); \
    43 } \
     43bool pmMaskBadPixels(pmReadout *in, const psImage *mask, unsigned int maskVal, float sat,
     44                     unsigned int growVal, int grow)
     45{
     46    int i = 0;
     47    int j = 0;
     48    int jj = 0;
     49    int ii = 0;
     50    int rRound = 0;
     51    int rowMin = 0;
     52    int rowMax = 0;
     53    int colMin = 0;
     54    int colMax = 0;
     55    int totOffCol = 0;
     56    int totOffRow = 0;
     57    float r = 0.0f;
     58    psElemType inType;
     59    psElemType maskType;
     60    psImage *inImage = NULL;
     61    psImage *inMask = NULL;
    4462
    4563
    46 /******************************************************************************
    47 GrowPixel(inMask, row, col, radius, maskVal): This private routine takes an
    48 input image mask and a pixel location, then sets (logical or) all pixels with
    49 parameter radius if that pixel to maskVal parameter.
    50 *****************************************************************************/
    51 psBool GrowPixel(
    52     psImage *inMask,
    53     psS32 col,
    54     psS32 row,
    55     psS32 radius,
    56     psU32 maskVal)
    57 {
    58     psS32 rowMin = PS_MAX(row-radius, 0);
    59     psS32 rowMax = PS_MIN(row+radius+1, inMask->numRows);
    60     psS32 colMin = PS_MAX(col-radius, 0);
    61     psS32 colMax = PS_MIN(col+radius+1, inMask->numCols);
    62     psF32 squareRadius = PS_SQR(radius);
     64    // Check for nulls
     65    if (in == NULL) {
     66        return true;   // Readout may not have data in it
     67    } else if(mask==NULL) {
     68        psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_NULL, true,
     69                 PS_ERRORTEXT_pmMaskBadPixels_NULL_MASK_IMAGE);
     70        return false;
     71    }
    6372
    64 
    65     for(psS32 i=rowMin; i<rowMax; i++) {
    66         for(psS32 j=colMin; j<colMax; j++) {
    67             // Old code:
    68             //            psF32 rRound = 0.5 + sqrtf((psF32) (((col-j)*(col-j)) + ((row-i)*(row-i))));
    69             //            if(rRound <= radius) {
    70             psF32 squareDis = (psF32) (((col-j)*(col-j)) + ((row-i)*(row-i)));
    71             if (squareDis <= squareRadius) {
    72                 inMask->data.U8[i][j] |= maskVal;
    73             }
    74         }
    75     }
    76     return(true);
    77 }
    78 
    79 /******************************************************************************
    80 GetRadius(inImg, col, row, sat, growVal, grow): This private routine takes an
    81 input image and pixel location and determines what radius that pixel must grow
    82 by.
    83  
    84 //XXX: Inline this or macro it for speed.
    85  *****************************************************************************/
    86 static psS32 GetRadius(
    87     psImage *inImg,
    88     psS32 col,
    89     psS32 row,
    90     psF32 sat,
    91     psU32 growVal,
    92     psS32 grow)
    93 {
    94     psS32 growRadius = 0;
    95     if (inImg->type.type == PS_TYPE_F32) {
    96         if(inImg->data.F32[row][col] == growVal) {
    97             growRadius = grow;
    98         }
    99         if (inImg->data.F32[row][col] > sat) {
    100             growRadius = PS_MAX(growRadius+1, 2);
    101         }
    102     } else if (inImg->type.type == PS_TYPE_S32) {
    103         if(inImg->data.S32[row][col] == growVal) {
    104             growRadius = grow;
    105         }
    106         if (inImg->data.S32[row][col] > sat) {
    107             growRadius = PS_MAX(growRadius+1, 2);
    108         }
    109     } else if (inImg->type.type == PS_TYPE_U16) {
    110         if(inImg->data.U16[row][col] == growVal) {
    111             growRadius = grow;
    112         }
    113         if (inImg->data.U16[row][col] > sat) {
    114             growRadius = PS_MAX(growRadius+1, 2);
    115         }
    116     } else {
    117         psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_TYPE, true,
    118                  PS_ERRORTEXT_pmMaskBadPixels_TYPE_MASK_IMAGE,
    119                  inImg->type.type);
    120     }
    121     return(growRadius);
    122 }
    123 
    124 
    125 bool pmMaskBadPixels(
    126     pmReadout *in,
    127     const pmReadout *mask,
    128     unsigned int maskVal,
    129     float sat,
    130     unsigned int growVal,
    131     int grow)
    132 {
    133     // XXX: Review this code then put all asserts at the top.
    134     PS_ASSERT_PTR_NON_NULL(in, true);
    135     PS_ASSERT_PTR_NON_NULL(in->image, false);
    136     PS_WARN_PTR_NON_NULL(in->parent);
    137     if (in->parent != NULL) {
    138         PS_WARN_PTR_NON_NULL(in->parent->concepts);
    139     }
    140     PS_ASSERT_PTR_NON_NULL(mask, false);
    141     int i = 0;
    142     int j = 0;
    143     int totOffCol = 0;
    144     int totOffRow = 0;
    145     psElemType inType;
    146     psElemType maskType;
    147     psImage *inMask = NULL;
    148 
    149     //
    150     // Determine trimmed image from metadata.
    151     //
    152     psImage *trimmedImg = p_psDetermineTrimmedImage(in);
    153     if(in->mask == NULL) {
    154         in->mask = psImageAlloc(trimmedImg->numCols, trimmedImg->numRows, PS_TYPE_MASK);
    155         PS_IMAGE_SET_U8(in->mask, 0);
     73    inImage = in->image;
     74    if (inImage == NULL) {
     75        psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_NULL, true,
     76                 PS_ERRORTEXT_pmMaskBadPixels_NULL_INPUT_IMAGE);
     77        return false;
     78    } else if(in->mask == NULL) {
     79        in->mask = psImageAlloc(inImage->numCols, inImage->numRows, PS_TYPE_MASK);
     80        memset(in->mask->data.V[0], 0, inImage->numCols*inImage->numRows*PSELEMTYPE_SIZEOF(PS_TYPE_MASK));
    15681    }
    15782    inMask = in->mask;
    15883
    15984    // Check input image and its mask are not larger than mask
    160     if(trimmedImg->numRows > mask->image->numRows || trimmedImg->numCols > mask->image->numCols) {
     85    if(inImage->numRows > mask->numRows || inImage->numCols > mask->numCols) {
    16186        psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_SIZE, true,
    16287                 PS_ERRORTEXT_pmMaskBadPixels_SIZE_INPUT_IMAGE,
    163                  trimmedImg->numRows, trimmedImg->numCols, mask->image->numRows, mask->image->numCols);
     88                 inImage->numRows, inImage->numCols, mask->numRows, mask->numCols);
    16489        return false;
    165     } else if(inMask->numRows > mask->image->numRows || inMask->numCols > mask->image->numCols) {
     90    } else if(inMask->numRows>mask->numRows || inMask->numCols>mask->numCols) {
    16691        psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_SIZE, true,
    16792                 PS_ERRORTEXT_pmMaskBadPixels_SIZE_MASK_IMAGE,
    168                  inMask->numRows, inMask->numCols, mask->image->numRows, mask->image->numCols);
     93                 inMask->numRows, inMask->numCols, mask->numRows, mask->numCols);
    16994        return false;
    17095    }
    17196
    17297    // Determine total offset based on image offset with chip offset
    173     totOffCol = trimmedImg->col0 + in->col0;
    174     totOffRow = trimmedImg->row0 + in->row0;
     98    totOffCol = inImage->col0 + in->col0;
     99    totOffRow = inImage->row0 + in->row0;
    175100
    176101    // Check that offsets are within image limits
    177     if(totOffRow>=mask->image->numRows || totOffCol>=mask->image->numCols) {
     102    if(totOffRow>=mask->numRows || totOffCol>=mask->numCols) {
    178103        psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_SIZE, true,
    179104                 PS_ERRORTEXT_pmMaskBadPixels_OFFSET_MASK_IMAGE,
    180                  totOffRow, totOffCol, mask->image->numRows, mask->image->numCols);
     105                 totOffRow, totOffCol, mask->numRows, mask->numCols);
    181106        return false;
    182     } else if(totOffRow>=trimmedImg->numRows || totOffCol>=trimmedImg->numCols) {
     107    } else if(totOffRow>=inImage->numRows || totOffCol>=inImage->numCols) {
    183108        psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_SIZE, true,
    184109                 PS_ERRORTEXT_pmMaskBadPixels_OFFSET_INPUT_IMAGE,
    185                  totOffRow, totOffCol, trimmedImg->numRows, trimmedImg->numCols);
     110                 totOffRow, totOffCol, inImage->numRows, inImage->numCols);
    186111        return false;
    187112    } else if(totOffRow>=inMask->numRows || totOffCol>=inMask->numCols) {
    … …  
    193118
    194119    // Check for incorrect types
    195     inType = trimmedImg->type.type;
    196     maskType = mask->image->type.type;
     120    inType = inImage->type.type;
     121    maskType = mask->type.type;
    197122    if(PS_IS_PSELEMTYPE_COMPLEX(inType)) {
    198123        psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_TYPE, true,
    … …  
    207132    }
    208133
    209     //
    210     // This is the main loop which examines each pixel and masks pixels if
    211     //    A: The mask matches the maskValue
    212     //    B: The pixel is larger than the saturation value
    213     //    C: The pixel equals the grow value (in which case a circle is masked)
    214     //
    215     for(i=totOffRow; i<trimmedImg->numRows; i++) {
    216         for(j=totOffCol; j<trimmedImg->numCols; j++) {
    217             //
    218             // A: Pixels which satisfy maskVal shall be masked
    219             //
    220             if (mask->image->data.U8[i][j] == maskVal) {
    221                 in->mask->data.U8[i][j] |= maskVal;
    222             }
     134    // Macro for all PS types
     135    #define PM_BAD_PIXELS(TYPE)                                                                              \
     136case PS_TYPE_##TYPE:                                                                                         \
     137    for(j=totOffRow; j<inImage->numRows; j++) {                                                              \
     138        for(i=totOffCol; i<inImage->numCols; i++) {                                                          \
     139            \
     140            /* Pixels with flux greater than sat shall be masked */                                          \
     141            if(inImage->data.TYPE[j][i] > sat) {                                                             \
     142                inMask->data.PS_TYPE_MASK_DATA[j][i] |= PM_MASK_SAT;                                         \
     143            }                                                                                                \
     144            \
     145            /* Pixels which satisfy maskVal shall be masked */                                               \
     146            inMask->data.PS_TYPE_MASK_DATA[j][i] |= (mask->data.PS_TYPE_MASK_DATA[j][i]&maskVal);            \
     147            \
     148            /* Pixels which satisfy growVal and within the grow radius shall be masked */                    \
     149            if(mask->data.PS_TYPE_MASK_DATA[j][i] & growVal) {                                               \
     150                rowMin = MAX(j-grow, 0);                                                                     \
     151                rowMax = MIN(j+grow+1, inImage->numRows);                                                    \
     152                colMin = MAX(i-grow, 0);                                                                     \
     153                colMax = MIN(i+grow+1, inImage->numCols);                                                    \
     154                for(jj=rowMin; jj<rowMax; jj++) {                                                            \
     155                    for(ii=colMin; ii<colMax; ii++) {                                                        \
     156                        r = sqrtf((ii-i)*(ii-i)+(jj-j)*(jj-j));                                              \
     157                        rRound = r + 0.5;                                                                    \
     158                        if(rRound <= grow) {                                                                 \
     159                            inMask->data.PS_TYPE_MASK_DATA[jj][ii] |=                                        \
     160                                    (mask->data.PS_TYPE_MASK_DATA[j][i]&growVal);                            \
     161                        }                                                                                    \
     162                    }                                                                                        \
     163                }                                                                                            \
     164            }                                                                                                \
     165        }                                                                                                    \
     166    }                                                                                                        \
     167    break;
    223168
    224             //
    225             // We first determine how much we need to grow by and store this in
    226             // growRadius.
    227             //
    228             psS32 growRadius = GetRadius(trimmedImg, j, i, sat, growVal, grow);
    229 
    230             //
    231             // Grow the pixel mask if necessary.
    232             //
    233             if (growRadius != 0) {
    234                 GrowPixel(in->mask, j, i, growRadius, maskVal);
    235             }
    236         }
     169    // Switch to call bad pixel masking macro defined above
     170    switch(inType) {
     171        PM_BAD_PIXELS(U8);
     172        PM_BAD_PIXELS(U16);
     173        PM_BAD_PIXELS(U32);
     174        PM_BAD_PIXELS(U64);
     175        PM_BAD_PIXELS(S8);
     176        PM_BAD_PIXELS(S16);
     177        PM_BAD_PIXELS(S32);
     178        PM_BAD_PIXELS(S64);
     179        PM_BAD_PIXELS(F32);
     180        PM_BAD_PIXELS(F64);
     181    default:
     182        psError( PS_ERR_BAD_PARAMETER_TYPE, true,
     183                 PS_ERRORTEXT_pmMaskBadPixels_TYPE_UNSUPPORTED,
     184                 inType);
    237185    }
    238186
    239     return true;
     187    return false;
    240188}
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.